Jarqo'rg'on tumani Surxondaryo viloyatining janubiy qismida joylashgan. Tuman markazi Jarqo'rg'on shaharchasi hisoblanadi. Tuman Shimolda Qiziriq tumani, janubda Sho'rchi tumani, sharqda Qumqo'rg'on tumani bilan chegaradosh. Gʻarb tomonidan esa O‘zbekiston–Tojikiston davlat chegarasi o‘tadi