Elektron pochta protokollari internet orqali xat almashish uchun ishlatiladi. Eng ko‘p qo‘llaniladigan protokollar POP3, IMAP va SMTP hisoblanadi. POP3 xatlarni serverdan yuklab olish imkonini beradi va odatda 110-portdan foydalanadi. IMAP xatlarni serverda saqlanayotgan holda boshqarish imkonini beradi va odatda 143-portdan foydalanadi. SMTP esa xatlarni jo‘natish uchun ishlatiladi va 25-portdan foydalanadi. Ushbu protokollar elektron pochta xizmatlarini samarali va xavfsiz qilishga yordam beradi