Zarafshon okrugi, 700 kilometrdan ziyod uzunlikka ega boʻlib, daryo havzasi orqali gʻarbdan sharqqa choʻzilgan. Hududning iqlimi kontinental boʻlib, yillik oʻrtacha harorat shimolda 10 daraja Selsiydan janubda 20 daraja Selsiygacha oʻzgaradi