Qashqadaryo viloyatining tuproq turlari xilma-xil bo'lib, geografik joylashuviga qarab o'zgaradi. Viloyatda asosan tog' va tog' oldi hududlarida qo'rg'oshinli tuproqlar, tekisliklar va vodiylarda esa sho'rlangan tuproqlar ustunlik qiladi