Oqsil almashinuvining asosiy mexanizmlari hujayra ichidagi oqsillarning sintezi va parchalanishi jarayonlarini o'z ichiga oladi. Sintez ribosomalarda amalga oshiriladi, bunda RNA matritsasi asosida aminokislotalar ketma-ketligi shakllanadi. Oqsillar parchalanishi proteasoma yoki lizosomal yo'llar orqali sodir bo'ladi, bu jarayonlar eski yoki shikastlangan oqsillarni yo'q qiladi va qayta foydalanish uchun aminokislotalarni ajratib beradi