Molekulyar markerlar DNK yoki RNKdagi o‘ziga xos sekvensiyalar bo‘lib, genetik xilma-xillikni aniqlashda ishlatiladi. Polimorfizm, avloddan-avlodgacha barqaror o‘tish, yuqori aniqlik va sezgirlik, ko‘p marker turlari (RFLP, RAPD, AFLP, SSR, SNP) va boshqalar