Indolning biotransformatsiyasi jarayoni organizmda, ko'pincha mikroorganizmlar orqali sodir bo'ladi. Indol triptofanning parchalanishi natijasida hosil bo'lib, E. coli kabi bakteriyalar uni indolik kislotalarga aylantiradi. Bu jarayon dori vositalari ishlab chiqarishda qo'llanilishi mumkin