Atakama cho‘li dunyodagi eng quruq cho‘llardan biri bo‘lib, yillik o‘rtacha yog‘ingarchilik miqdori 15 mm atrofida, ba'zi joylarda esa yillar davomida umuman yomg‘ir yog‘masligi mumkin. Harorat kunduzda 40°C ga chiqishi, tunda esa 0°C gacha tushishi mumkin. Ekstremal iqlim sharoitlari tufayli vegetatsiya kam, lekin minerallarga boy. Astronomlar uchun Atakama ideal joy bo‘lib, uning yuqori balandligi va havoning tozaligi yulduzlarni kuzatish uchun qulay sharoit yaratadi