Farg‘ona tabiiy geografik okrugi O‘zbekistonning eng sharqida, Tyanshan va Oloy tog‘ tizimlari orasidagi Farg‘ona vodiysida joylashgan. Bu okrugning atrofi tog‘lar bilan o‘ralgan. Farg‘ona okrugini janubdan Turkiston va Oloy, sharqdan Farg‘ona va Otoynoq, shimoldan Chatqol, shimoli-g‘arbdan esa Qurama va Qoromozor tog‘ tizmalari, g‘arbdan Mo‘g‘ultog‘ o‘rab turadi. Faqat g‘arb tomondan okrug tor-gina (8–9 km) “Farg‘ona” yoki “Xo‘jand” darvozasi orqali Dalvarzin va Mirzacho‘l tekisliklari bilan tutashib ketadi. Farg‘ona vodiysining uzunligi g‘arbdan sharqqa 370 km, o‘rtacha kengligi 80–100 km, eng keng joyi esa sharqiy qismida bo‘lib, 150 km ga yetadi. Farg‘ona vodiysi bodom shakliga o‘xshaydi. Ma’muriy jihatdan Farg‘ona vodiysida O‘zbekistonning Andijon, Namangan, Farg‘ona viloyatlari, Qirg‘izistonning O‘sh viloyatining bir qismi va Tojikistonning Xo‘jand viloyatining bir qismi joylashgan.