Proteinlar turli biologik jarayonlarda muhim rol o'ynaydigan muhim molekulalardir. Protein tuzilishini bashorat qilish birinchi navbatda ketma-ketlik va strukturaviy homologiyaga asoslanadi. Protein tuzilishini bashorat qilish yoki modellashtirish juda muhim, chunki oqsilning funktsiyasi asosan uning 3D tuzilishiga bog'liq. Xuddi shunday, oqsilning 3D tuzilishi uning aminokislotalar tarkibiga bog'liq. Protein ketma-ketligidagi kichik o'zgarish mahalliy tuzilishda katta hajmdagi tarkibiy o'zgarishlarga olib kelishi mumkin. Proteinning 3D tuzilishini to'g'ri bilish juda muhim, ammo tananing fiziologik sharoitida yashaydigan oqsilning mahalliy tuzilishini ochish juda qiyin. X-nurli kristallografiyava yadro magnit-rezonans spektroskopiya (YMR) usullari asosan oqsil va oqsil-ligand komplekslarining tuzilishini aniqlash uchun ishlatiladi. Ushbu eksperimental tuzilmani aniqlash usullari juda ko'p vaqt talab etadi, qimmat va murakkab ( Baker & Sali, 2001 ). Natijada, hisoblash algoritmi va hisoblash vositalarining rivojlanishi bilan aminokislotalar ketma-ketligidan model yaratish uchun oqsil tuzilishi, dinamikasi va katlama haqidagi nazariy bilimlardan foydalanildi .